1、微波爐與烤箱的加熱原理。微波爐是通過微波震蕩物質分子使溫度提高的，使得水分子高速運動相互撞擊以產生熱量，就是靠食物內部分子振動產生熱量，分子運動越快，溫度越高，從而加熱食物。而烤箱的加熱原理是用電加熱電阻絲使其發熱，產生的熱量通過熱傳遞方式對食物由外而內加熱，所以其實微波爐跟烤箱的加熱原理並不一樣。
2、微波爐加熱是由內而外的，而烤箱是由外而內的，微波加熱如果不均勻，接受最大微波的點會先熱起來，而烤箱則會先焦表皮因此，由於微波爐和電烤箱在燒烤原理上的不同決定瞭它們燒烤效果的不同。
3、原理不同：微波爐燒烤功能是發出微波，使食物中的水分子鏈發生高速振蕩生熱，是從食品內部給它們加熱。烤箱則相反，是通過紅外線從外部給食品加熱。可以用微波爐燒烤功能做蛋糕和面包，但是效果沒有烤箱好。
4、加熱效果不同：微波爐利用微波令食物分子高速振動產生熱量，在加熱的同時，會使食物的水分和營養流失。雖然它加熱速度很快，但食物也容易變幹，假如你放進去的是一個冰冷的饅頭，加熱後拿出來饅頭就會變的硬邦邦的，完全沒有軟乎乎的感覺。
5、側重點不同：微波爐加熱速度快，加熱方便，因此微波爐主要用來快速翻熱食物，能節省不少時間；而烤箱用來加熱食物就不大適合瞭，比微波爐多花時間不說，且耗電量大，隻用來烘焙食物就好，面包、蛋糕、比薩、烤肉等眾多美食，都可以很好的做出來。
一般來說，微波爐隻是一個快速翻熱工具，其他的烹飪食物，色香味都不行。雖然加熱速度較快，但在加熱過程中食物本身的水分及營養成分喪失嚴重。即使具有燒烤功能的微波爐也很難做好烤箱出色的烘焙效果。烤箱的加熱方式不會破壞食物原有的美味，更可保留食物中所含有的水份和營養成分，烹制的食物外酥內嫩，比較適合東方人的口味。微波爐的主要功能是快速翻熱，但如果要烤肉之類的，則更加應該選用烤箱。
