1、《創世紀》第6章到第9章記載瞭諾亞方舟的故事。創造世界萬物的上帝耶和華見到地上充滿敗壞、強暴和不法的邪惡行為，於是計劃用洪水消滅惡人。同時他也發現，人類之中有一位叫做諾亞的好人。《創世紀》記載：“諾亞是個義人，在當時的世代是個完全人”。耶和華神指示諾亞建造一艘方舟，並帶著他的妻子、兒子（閃、含與雅弗）與媳婦。同時神也指示諾亞將牲畜與鳥類等動物帶上方舟，且必須包括雌性與雄性。
2、當方舟建造完成時，大洪水也開始瞭，這時諾亞與他的傢人，以及動物們皆已進入瞭方舟。《創世紀》如此形容洪水剛開始的景況：“當諾亞六百歲，二月十七日那一天，大淵的泉源都裂開瞭，天上的窗戶也敞開瞭。四十晝夜降大雨在地上”。洪水淹沒瞭最高的山，在陸地上的生物全部死亡，隻有諾亞一傢人與方舟中的生命得以存活。
3、在220天之後，方舟在阿勒山附近停下，且洪水也開始消退。又經過瞭40天之後，阿勒山的山頂才露出。這時諾亞放出瞭一隻烏鴉，但它並沒有找到可以棲息的陸地。7天之後諾亞又再次放出鴿子，這次它立刻就帶回瞭橄欖樹的枝條，諾亞這時知道洪水已經散去。又等瞭7天之後，諾亞最後一次放出鴿子，這次它便不再回方舟瞭。諾亞一傢人與各種動物便走出方舟。
4、離開方舟之後，諾亞將一隻祭品獻給神。耶和華聞見獻祭的香氣決定不再用洪水毀滅世界，並在天空制造瞭一道彩虹，作為保證。在《創世紀》中，神如此保證：“我使雲彩蓋地的時候，必有虹現在雲彩中，我便紀念我與你們和各樣有血肉的活物所立的約，水就再不泛濫、毀壞一切有血肉的物瞭。”
