《女醫明妃傳》結局如下。
1、吳太後數次找到祁鈺大鬧。祁鈺不堪母親刺激,在除夕夜突然病發,意外病逝。吳太後認定是允賢醫術不精,害死瞭兒子,要允賢為祁鈺殉葬。
2、為救允賢,英宗不得不趁夜入宮,並在擁護他的大臣幫助下,登基為皇,下旨從此廢除殉葬制度。允賢逃脫瞭殉葬的命運,卻意外地失去瞭腹中的孩子。
3、她得知英宗登基後,悄悄離開宮中,隨戲班一起遠走天涯。英宗在政事上勵精圖治,在宮中推行女醫制度,十年之後他傳位太子,自己四處私訪,終於再度找到瞭允賢。
4、因為允賢和英宗的作為,不少民間女子開始行醫,大眾漸漸接受瞭女子行醫的事實,女子的壽命大為提高。