註射腮腺炎疫苗的不良反應，與註射其他疫苗引起的不良反應基本上類似，常可以出現以下幾種情況：第一、發燒：通常在註射疫苗之後，當天或者第二天可以出現發燒，一般體溫不超過38℃，多數情況下表現為低燒。一般持續2-3天的時間，體溫可以自行恢復到正常，通常不需要特殊的處理。如果發燒恢復的比較快，在當天體溫就可以恢復到正常。第二、全身不適反應：患者可以出現頭疼、肌肉及關節疼痛、乏力、食欲減退、惡心等全身不適的癥狀及表現。第三、局部反應：註射的局部可以出現不適反應，有些患者可以出現註射部位的疼痛，或者註射部位的胳膊上肢出現疼痛。有些註射的部位可以出現局部紅腫、硬結，嚴重時可能會出現局部滲出。這種情況一般也不需要特殊的處理，大約2-3天可以逐漸緩解。第四、過敏反應：通常情況下，對於既往註射疫苗出現過敏反應或者本身是過敏體質的患者，註射後可能會出現過敏反應。過敏反應與服用藥物出現的反應基本上類似，最多見的是出現過敏性蕁麻疹，也就是風團樣皮疹，可以伴有瘙癢，也可以伴有血管神經性的水腫，可出現眼瞼以及口唇水腫，或者顏面部出現水腫。最嚴重的不良反應是出現喉頭水腫，或者出現過敏性休克，這種情況屬於急癥，需要及時到醫院就診。
